miRNA测序分析
产品简介
小RNA(small RNA)是存在于生物体内的一类高度保守的RNA,序列的长度一般在18-32nt之间,小RNA包括了微小RNA(microRNA, miRNA),小干扰RNA(siRNA),核仁小RNA(snoRNA)和piRNA等。MicroRNA通过与mRNA相互作用影响目标mRNA的稳定性及翻译,最终诱导基因沉默,调控基因表达、细胞生长、发育等生物学过程。对Small RNA 的测序分析可以得到物种全基因组水平的Small RNA 图谱,挖掘新Small RNA 分子、预测靶基因、样品间差异表达分析、聚类分析等应用。
韦翰斯生物通过富集样本中所有的特定长度的小RNA片段进行测序和表达定量,一次性可以获得数百万条小RNA的序列信息,并依托后续强大的生物信息分析平台,可以实现小RNA的各类信息分析,鉴定已知或探索未知小RNA与其靶作用基因以及解析各类小RNA之间或与mRNA的互作关系等。
技术路线
数据分析
lncRNA分析内容
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基本分析
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高级分析
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原始数据质控及评估
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与mRNA关联分析(需有mRNA数据)
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与miRNA数据库比对分析
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与lncRNA关联分析(需有lncRNA数据)
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小RNA分类及注释
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miRNA靶基因预测
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差异表达分析
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个性化分析
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案例展示
Plasma MicroRNA Pair Panels as Novel Biomarkers for Detection of Early Stage Breast Cancer
血浆microRNA对可作为早期乳腺癌检测的新标志物
乳腺癌是影响女性健康的重要疾病,早发现、早诊断、早治疗是提高疗效的关键。但目前的标志物假阳性率比较高,灵敏度较低。
研究人员对乳腺癌患者、良性病变者、正常人进行microRNA测序,对其中13个差异表达microRNA进行qPCR验证,通过构建筛查模型证实了5个pairs可作为早期诊断标记物。
Fang R , Zhu Y , Hu L , et al. Plasma MicroRNA Pair Panels as Novel Biomarkers for Detection of Early Stage Breast Cancer[J]. Frontiers in Physiology, 2019, 9.