IncRNA测序分析

产品简介

长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)是一类广泛存在于生物体内、长度超过200 nt、不编码蛋白的RNA。lncRNA在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达、疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。

lncRNA高通量测序,采用去核糖体建库方法,对长链非编码RNA等大RNA进行测序研究,从而快速全面准确地获得与特定生物学过程(例如发育、疾病等)所有大RNA转录本数据信息,结果更全面,可应用于细胞分化和发育的研究、调控机理的研究、疾病标志物的寻找、疾病的分子诊断、基因药物的研发等。


技术路线


数据分析

lncRNA分析内容

基本分析

高级分析

原始数据质控及评估

与mRNA关联分析

lcnRNA表达水平分析

lncRNA靶基因预测

lcnRNA差异表达分析

个性化分析

GO和KEGG富集分析

新lcnRNA预测


案例展示

Long non-coding RNAs control hematopoietic stem cell function

长链非编码RNA可调控造血干细胞功能

LncRNA是基因表达的重要调节因子,但lncRNA在造血干细胞的功能不清楚。研究人员通过对造血干细胞转录组进行深度测序,鉴定出了323个未注释的lncRNA,通过比较已分化的细胞谱系中的表达,鉴定出了159个lncRNAs富集在造血干细胞中,其中一些可能是HSC特异性的。这些lncRNA基因与蛋白编码基因具有相同的表观遗传特征,包括通过DNA甲基化调控表达,敲除掉两个lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2,对HSC自我更新和谱系决定具有不同的影响。这些结果表明,lncRNA在调控造血干细胞功能方面,起着重要的作用。


Luo M , Jeong M , Sun D , et al. Long Non-Coding RNAs Control Hematopoietic Stem Cell Function[J]. Cell Stem Cell, 2015, 16(4):426-438.




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