长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类广泛存在于生物体内、长度超过200 nt、不编码蛋白的RNA。lncRNA在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达、疾病的病理生理过程中起着重要的调节作用。
lncRNA高通量测序，采用去核糖体建库方法，对长链非编码RNA等大RNA进行测序研究，从而快速全面准确地获得与特定生物学过程（例如发育、疾病等）所有大RNA转录本数据信息，结果更全面，可应用于细胞分化和发育的研究、调控机理的研究、疾病标志物的寻找、疾病的分子诊断、基因药物的研发等。
lncRNA分析内容
基本分析
高级分析
原始数据质控及评估
与mRNA关联分析
lcnRNA表达水平分析
lncRNA靶基因预测
lcnRNA差异表达分析
个性化分析
GO和KEGG富集分析
新lcnRNA预测
Long non-coding RNAs control hematopoietic stem cell function
长链非编码RNA可调控造血干细胞功能
LncRNA是基因表达的重要调节因子，但lncRNA在造血干细胞的功能不清楚。研究人员通过对造血干细胞转录组进行深度测序，鉴定出了323个未注释的lncRNA，通过比较已分化的细胞谱系中的表达，鉴定出了159个lncRNAs富集在造血干细胞中，其中一些可能是HSC特异性的。这些lncRNA基因与蛋白编码基因具有相同的表观遗传特征，包括通过DNA甲基化调控表达，敲除掉两个lncHSCs——lncHSC-1和lncHSC-2，对HSC自我更新和谱系决定具有不同的影响。这些结果表明，lncRNA在调控造血干细胞功能方面，起着重要的作用。
Luo M , Jeong M , Sun D , et al. Long Non-Coding RNAs Control Hematopoietic Stem Cell Function[J]. Cell Stem Cell, 2015, 16(4):426-438.
